Процедура назначается в случае:
- расхождения свидетельских показаний участников процесса;
- отсутствия доказательной базы и улик;
- при невозможности установить истину иными способами.

Положение о полиграфологах.     
• Важным обязательством полиграфолога является  ответственность за написание заключения  для следствия, которое будет иметь статус полноценного доказательства вины или невиновности подсудимого, вне зависимости от того, кто подвергался детекции лжи — обвиняемый, свидетель, истец, ответчик и т. д.
• Заключение специалиста-полиграфолога является полновесным доказательством, которое предоставляется на рассмотрении дела.
• Полиграфолог обязан быть непредвзят и иметь статус эксперта.
• Если компетенция полиграфолога либо исправность полиграфа подвержена сомнению, следователь имеет прво назначить экспертизу на другом аппарате либо у другого полиграфолога.

В каких случаях запрещена процедура проверки с использованием  полиграфа:
1. Если субъект недееспособен.
2. Если субъект пребывает в алкогольном или наркотическом опьянении,
либо под действием транквилизаторов, и это подтверждено независимой медицинской экспертизой.
3. Если субъект женского пола находится в положении, и это подтверждено независимой медицинской экспертизой.
4. Если субъекту не исполнилось 14 лет (с 14 до 18 лет процедура
возможна лишь с письменного согласия родителей либо лиц, выполняющих функцию опеки и в их присутствии).
5. Если субъект находится на грани физического или эмоционального 
Истощения, и это подтверждено независимой медицинской либо психологической экспертизой..
6. Если у субъекта наблюдается усугубление заболеваний сердечно-
сосудистой, либо дыхательной системы, и это подтверждено независимой медицинской экспертизой.
7. Если полиграфолог каким-то образом заинтересован в исходе дела.

Положение о защите людей, подвергающихся процедуре судебно-психофизиологического исследования:
• Привлечение эксперта к расследованию по ходатайству защиты: сторона защиты имеет полное право на сбор доказательной базы в пользу невиновности подозреваемого, в том числе, и на проведение психофизиологического исследования.
• Адвокат может привлекаться как со стороны (в случае финансового обеспечения деятельности адвоката подозреваемым), так и назначаться бесплатно государством.
• Если инициатива о назначении психофизиологического исследования исходит от защиты, то адвокат заполняет специальный запрос на ее осуществление.
• Адвокат подзащитного имеет право присутствовать на процедуре судебно-психиатрического исследования..

Приготовление к процедуре:
Следователь готовит назначение специалисту, который будет руководить процедурой, и уведомляет его об этом. (Постановление о проведении процедуры).
Следователь должен ознакомить полиграфолога со всеми обязательствами, которые тот несет, становясь участником процесса (уголовная ответственность за дачу заведомо ложного заключения и т. д.).
Проследить за ходом исследования имеет право следователь, ведущий дело, а также – адвокат лица, подвергающегося процедуре детекции лжи и родители в случае допроса несовершеннолетнего, либо лица, их замещающих. Кроме того, на это могут претендовать судьи и прочие лица, причастные к процессу. Но подобная практика осуществляется редко, так как присутствие посторонних лиц отвлекает внимание тестируемого.

Правила проведения исследования с применением полиграфа:
Необходимо задавать вопросы, на которые можно дать однозначные короткие положительные или отрицательные ответы («да» или «нет»), но никоим образом нельзя вопросом подсказывать опрашиваемому правильный (выгодный для него) ответ.
За время проведения процедуры вопросы могут задаваться по нескольку раз один и тот же, меняться по темам.
Процедура не должна длиться более трех часов подряд (для лиц, не достигших 18-тилетнего возраста – не более 1,5 часов).
Заключение, подготовленное специалистом, рассматривается следствием с точки зрения его компетентности и осведомленности в деле.
На подготовку  заключения дается 2 рабочих дня.

В заключении специалиста-полиграфолога содержится следующая информация:
- Число, месяц, год, время и адрес места проведения процедуры;
- Причины для проведения процедуры;
- Фамилия и имя,  должность лица, предписавшего проведение процедуры;
- Заявление от полиграфолога с согласием нести ответственность за заведомо ложное заключение;
- Цели, которые специалист ставит перед проведением процедуры;
- Информация о предоставленных материалах следствия;
- Сведения о присутствующих на процедуре, помимо  полиграфолога и проверяемого;
- Подробные данные о личности, над которой проводится  исследование: его фамилия и имя, возраст,  образование, специализация, должность, время работы и данные, собранные в соцсетях и сети Интернет;
-Ответы на вопросы, которые задаются лицу, подвергающемуся процедуре, связанные  непосредственно с причиной проведения процедуры;
- Результаты исследования с упоминанием использованных методик;
- Отчет специалиста о процедуре в целом: достигнуты ли поставленные цели и задачи, однозначны ли результаты и т. д.